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Mon nom M.Sc.
< + > Bioinformaticien
Expériences professionnelles
Professionnel de recherche - science de la biodiversité
Sherbrooke, CA
aujourd’hui - 2023
- Développement d’une infrastructure de données PostgreSQL permettant l’interaction automatisée avec des API externes et de fournir des requêtes structurées pour le portail ATLAS de Biodiversité Québec
- Implémentation de l’utilisation de standards de données tel que le DarwinCore (DwC) et l’Ecological Metadata Language (EML)
Stage KBA (Zones Clés pour la Biodiversité)
WCS Canada
À distance
2021
- Conception, développement et déploiement d’une application Shiny interfaçant les scripts R en place, pour faciliter la création de proposées KBA au niveau pancanadien
Stage Mangal
Laboratoire d’écologie intégrative - Université de Sherbrooke
Sherbrooke, CA
2019
- Formatter et intégrer des jeux de données de réseaux d’interactions dans la base de données Mangal
- Développement de scripts de validation et de formattage automatisé
Diplômes
M.Sc. écologie - Laboratoire d’écologie intégrative
Université de Sherbrooke
Sherbrooke, CA
2024 - 2020
- Modèles mécanisitques prédictifs de flux de biomasse en système prédateurs-proies
B.Sc. écologie
Université de Sherbrooke
Sherbrooke, CA
2020 - 2016
- Projet de recherche: « Reconstitution et structure des réseaux trophiques terrestres des vertébrés du Québec: une approche par KNN »
Enseignements
Méthodes computationnelles en écologie
BIO500 - Université de Sherbrooke
Sherbrooke, CA
2024 - 2021
- Assistant à l’enseignement
Introduction à la programmation scientifique
BIO109 - Université de Sherbrooke
Sherbrooke, CA
2023 - 2021
- Assistant à l’enseignement
Biométrie
BIO 101 - Université de Sherbrooke
Sherbrooke, CA
2023 - 2022
- Démonstrateur
Bénévolat
Tuteur, Centre d’entraide de Biologie
Départament de biologie - Université de Sherbrooke
Sherbrooke, CA
2022 - 2019
- Tutorat général pour élèves
Publications
Graph embedding and transfer learning can help predict potential species interaction networks despite data limitations
Methods in Ecology and Evolution -
N/A
2023
- T Strydom, S Bouskila, F Banville, C Barros, D Caron, M J.Farrell, MJ Fortin, B Mercier, L J.Pollock, R Runghen, G V.Dalla Riva, T Poisot
Food web reconstruction through phylogenetic transfer of low-rank network representation
Methods in Ecology and Evolution -
N/A
2022
- T Strydom, S ouskila, F Banville, C Barros, D Caron, M J.Farrell, MJ Fortin, V Hemming, B Mercier, L J.Pollock, R Runghen, G V.Dalla Riva, T poisot
A roadmap towards predicting species interaction networks (across space and time)
Philosophical Transactions of the Royal Society B
N/A
2021
- T Strydom, MD Catchen, F Banville, D Caron, G Dansereau, P Desjardins-Proulx, NR Forero-Muñoz, G Higino, B Mercier, A Gonzalez, D Gravel, L Pollock, T Poisot
Global knowledge gaps in species interaction networks data
N/A
2021
- T Poisot, G Bergeron, K Cazelles, T Dallas, D Gravel, A Macdonald, B Mercier, C Violet, S Vissault.
R package - rmangal
N/A
N/A
2019
- Vissault S, Cazelles K, Bergeron G, Mercier B, Violet C, Gravel D, Poisot T (2019). rmangal: An R package to interact with Mangal database. R package version 2.0.0.